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論述PCR反應條件的控制
點(diǎn)擊次數:832 更新時(shí)間:2022-06-28
        PCR反應條件為溫度、時(shí)間和循環(huán)次數。
  溫度與時(shí)間的設置:基于PCR原理三步驟而設置變性-退火-延伸三溫度點(diǎn)。在標準反應中采用三溫度點(diǎn)法,雙鏈DNA在90~95℃變性,再迅速冷卻至40 ~60℃,引物退火并結合到靶序列上,然后快速升溫至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物鏈沿模板延伸。對于較短靶基因(長(cháng)度為100~300bp時(shí))可采用二溫度點(diǎn)法,除變性溫度外、退火與延伸溫度可合二為一,一般采用94℃變性,65℃左右退火與延伸(此溫度Taq DNA酶仍有較高的催化活性)。PCR反應條件的控制如下:
1.  PCR反應的緩沖液提供合適的酸堿度與某些離子 。
2.  鎂離子濃度總量應比dNTPs的濃度高,常用1.5 mmol/L。
3.  底物濃度dNTP以等摩爾濃度配制,20~200 umol/L。
4.  TaqDNA聚合酶2.5U(100 ul)。 
5.  引物 濃度一般為0.1 ~0.5 umol/L。 
6.  反應溫度
(1)變性溫度和時(shí)間95℃,30 s。
(2)退火溫度和時(shí)間 低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃。
(3)延伸溫度和時(shí)間72℃,1 min/kb(10 kb內)。
(4)Tm值=4(G+C) +2(A+T)。

7.  循環(huán)次數 

一般為25 ~30次。循環(huán)數決定PCR擴增的產(chǎn)量。模板初始濃度低,可增加循環(huán)數以便達到有效的 擴增量。但循環(huán)數并不是可以無(wú)限增加的。一般循環(huán)數為30個(gè)左右,循環(huán)數超過(guò)30個(gè)以后,DNA聚合酶活性逐漸達到飽和,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數的增加而增加,出現了所謂的“平臺期"。


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